MEKANISME ANTI THROMBIN DAUN SIRSAK (Annona muricata) MELALUI PENGHAMBATAN PROTEIN THROMBIN DAN HUMAN VKOR DENGAN STUDI IN SILICO

Abstract

ABSTRAK

Pendahuluan: Stroke adalah penyakit defisit neurologis yang disebabkan karena gangguan vaskularisasi otak akibat thrombus atau pecahnya pembuluh darah. Daun sirsak  mengandung senyawa aktif golongan flavonoid, alkaloid, tannin, dan terpenoid yang diketahui memiliki potensi sebagai trombolitik melalui penghambatan pembentukan thrombin. Penelitian ini memiliki tujuan untuk mengetahui afinitas senyawa aktif daun sirsak sebagai trombolitik melalui penghambatan protein thrombin (1ZGI) dan protein VKOR (6WV6) secara in silico.  

Metode: Penelitian secara in silico menggunakan metode molecular docking, prediksi fisikokimia dan farmakokinetik. Protein target menggunakan protein thrombin (1ZGI) dan human vkor (6WV6) senyawa aktif daun sirsak diperoleh melalui literatur dan website dr duke. Skrinning senyawa daun sirsak sebagai trombolitik menggunakan website PASS online proses docking menggunakan aplikasi pyrx. Nilai energi bebas dan kemiripan ikatan residu asam amino digunakan sebagai indikator affinitas ligan terhadap protein, dan visualisasi docking menggunakan biovia Analisa data secara deskriptif analitik.

Hasil: Hasil skrinning didapatkan 22 senyawa aktif memiliki nilai Pa (probability activity) >0,5. hasil doking ligan terhadap protein thrombin terbaik yaitu procyanidin (∆G-9.5kkal/mol) dengan kesamaan residu asam amino (45%), adapun terhadap protein human VKOR yaitu coclaurine ∆G-8.9kkal/mol dengan persamaan residu asam amino (87%) Hasil prediksi fisikokimia dan farmakokinetik didapatkan bahwa coclaurine mempunyai kelarutan dan bioavaibilitas yang tinggi namun bersifat hepatotoksik.

Kesimpulan: Senyawa aktif daun sirsak yaitu coclaurine diprediksi berpotensi menghambat protein thrombin dan human VKOR dan dapat dikembangkan sebagai obat oral. Namun pemberian jangka Panjang masih perlu dikaji lebih lanjut karena adanya potensi hepatotoksik.

Kata Kunci: Trombolitik, Anti thrombin, Annona muricata; in silico.