SIMULASI MOLECULAR DOCKING AKTIVITAS ANTIINFLAMASI EKSTRAK METANOL KULIT BUAH MATOA (Pometia pinnata) SEBAGAI INHIBITOR FOSFOLIPASE A2 DAN PROSTAGLANDIN D2

Rima Cahyaningtias, Denis Mery Mirza, Andri Tilaqza

Abstract


ABSTRAK

Pendahuluan: Osteoarthritis (OA) merupakan penyakit sendi yang ditandai kerusakan progresif seluruh sendi sinovial. Prevalensi OA tergolong tinggi dengan obat antiinflamasi nonsteroid (OAINS) sebagai pilihan terapi lini pertama. Namun, penggunaan OAINS jangka panjang dapat menimbulkan efek samping gangguan pada lambung. Oleh karena itu, perlu adanya pengembangan terapi berbasis bahan alam yang selektif terhadap PLA2 dan PGD2. Matoa merupakan tanaman khas Indonesia yang secara empiris digunakan sebagai antiinflamasi. Penelitian ini bertujuan mengetahui potensi antiinflamasi senyawa aktif ekstrak metanol kulit buah matoa pada enzim PLA2 dan PGD2 secara molecular docking.

Metode: Sebanyak 27 Senyawa aktif ekstrak metanol kulit buah matoa (Pometia pinnata) diperoleh dari hasil metabolit profiling menggunakan metode LC-HRMS. Analisis docking diawali dengan proses validasi gridbox menggunakan RMSD terkecil dari ligand ko-kristal pada masing-masing enzim dengan webserver DockRMSD. Senyawa ditambatkan dengan enzim PLA2 (PDB ID: 4QF7) dan PGD2 (PDB ID: 1S2A) dan dilakukan visualisasi 2D dan 3D untuk mengevaluasi interaksi dan pose ligan dalam poket enzim, menggunakan skoring Autodock vina pada perangkat Pyrx 0.8.

Hasil dan Pembahasan: Hasil penambatan ligan uji matoa terhadap enzim PLA2 menunjukkan, ligan uji protocatechuic acid (-5.8 kcal/mol), pipecolic acid (-5.2 kcal/mol), dan sorbic acid (∆G = -5.1 kcal/mol) memiliki kemiripan interaksi tertinggi (66,67%) terhadap ligan kontrol kortikosteron (-6.6 kcal/mol). Penambatan pada PGD2 menunjukkan ligan uji curcumene (-7.5 Kkal/mol) dengan similaritas 25%, stearidonic acid (-7.7 Kkal/mol) dengan similaritas 12.5%, dan α-Linolenic acid (-7.5 Kkal/mol) dengan similarity 12.5%, dibandingkan kontrol indometasin (-9.6 Kkal/mol).

Simpulan: Senyawa aktif ekstrak metanol kulit buah matoa berpotensi sebagai inhibitor enzim PLA2 dan PGD2 secara molecular docking.

Kata Kunci: Antiinflamasi, Matoa, Molecular Docking, Osteoarthritis


Full Text:

PDF

Refbacks

  • There are currently no refbacks.